Messi setter fra venstre var ledet av Marcos Rojo, traff en strandet Kolasinac og krøp forbi målvakt Asmir Begovic for det raskeste eget mål i verdensmesterskapets historie.
Izet Hajrovic hadde nesten Bosnienivå i det 13. minutt, men målvakten Sergio Romero krypet bort etter at midtbanespillerens første første berøring hadde skjedd.
Til tross for den forferdelige starten så Susks side Liverpool Drakt Barn komfortabel i forsvaret og manglet bare noen polsk i den angripende tredje.
Maxi Rodriguez fløyte godt over fra 30 meter like etter halvtimesmerket til Argentina, mens Javier Mascheranos innsats fra rekkevidde tvang Begovic inn i lagre øyeblikk senere.
En off-balance Dzeko prøvde lykken sin fra utenfor området i det 33. minutt, men han krøllet sin venstrefotet skudd over baren.
En stort sett kjedelig første halvdel ble brakt til liv fire minutter før halvtid.
Senad Lulic hadde nesten Bosnienes utligning fra et Miralem Pjanic-hjørne, bare for Romero å skyve headeren rundt innlegget sitt i siste sjanse til halv.
Misfornøyd med sin side første halvdel, Sabella gjorde to endringer i pausen da Higuain og Fernando Gago erstattet Rodriguez og Hugo Campagnaro.
Men Bosnia ble igjen på foten etter intervallet da Hajrovic slo et frispark rett på Romero fra 25 meter i det 50. minutt og så skutt rett mot ham fra rekkevidde.
Sergio Aguero’s streik fra en vinkel manglet kraft og Fotballdrakt med eget navn barn retning til å alvorlig trøbbel Begovic etter at han var tann opp av Messi.
Messi hadde slettet en god frisparkskans før han doblet Argentinas ledelse i 65. minutt.
Barcelona-stjernen utvekslet passerer med Higuain, hoppet over en utfordring og plasserte sin venstrefotet skudd inn av stolpen fra kanten av området.
Ibisevic trakk et mål tilbake til Susks side da han poked gjennom Romero sine bein etter en fin ball gjennom Lulic, men Argentina fortsatte.